Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PAX8Q06710 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms