Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA7P31268 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms