Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF1P22415 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF1P22415 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF1P22415 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF1P22415 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF1P22415 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF1P22415 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF1P22415 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
USF1P22415 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF1P22415 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF1P22415 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF1P22415 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
USF1P22415 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
USF1P22415 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF1P22415 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF1P22415 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF1P22415 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF1P22415 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF1P22415 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF1P22415 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF1P22415 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF1P22415 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF1P22415 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF1P22415 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF1P22415 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF1P22415 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF1P22415 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
USF1P22415 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF1P22415 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF1P22415 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF1P22415 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF1P22415 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF1P22415 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF1P22415 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF1P22415 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF1P22415 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF1P22415 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF1P22415 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF1P22415 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF1P22415 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF1P22415 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
USF1P22415 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
USF1P22415 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
USF1P22415 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
USF1P22415 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
USF1P22415 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
USF1P22415 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
USF1P22415 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF1P22415 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF1P22415 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF1P22415 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF1P22415 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF1P22415 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF1P22415 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF1P22415 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF1P22415 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
USF1P22415 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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