Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG7O95352 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ATG7O95352 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ATG7O95352 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG7O95352 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG7O95352 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG7O95352 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG7O95352 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG7O95352 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG7O95352 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG7O95352 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG7O95352 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG7O95352 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG7O95352 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG7O95352 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG7O95352 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG7O95352 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG7O95352 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG7O95352 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG7O95352 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG7O95352 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG7O95352 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG7O95352 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG7O95352 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG7O95352 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG7O95352 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG7O95352 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG7O95352 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG7O95352 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG7O95352 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG7O95352 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG7O95352 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG7O95352 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG7O95352 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG7O95352 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG7O95352 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG7O95352 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG7O95352 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG7O95352 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG7O95352 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG7O95352 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG7O95352 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG7O95352 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms