Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPASTQ9UBP0 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms