Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB18Q9NP72 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms