Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 SLC44A4-202ENST00000229729 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AC237221.1-202ENST00000563054 2947 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 CCDC148-201ENST00000283233 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C2orf88Q9BSF0 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms