Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 OR52M1-201ENST00000360213 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 LYZL2-201ENST00000375318 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM107B-202ENST00000378458 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 LYZL4-202ENST00000441172 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC117395.3-201ENST00000471176 680 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 BX293995.1-201ENST00000502880 755 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC106744.1-201ENST00000504827 660 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 HNRNPA3P7-201ENST00000521638 982 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 PDCL3P1-201ENST00000534575 734 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 PGA4-202ENST00000537932 840 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC073651.2-201ENST00000544148 660 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 IFI27L1-205ENST00000554544 406 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 HMGN2P46-207ENST00000568669 388 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC046185.2-201ENST00000603263 413 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005609.2-201ENST00000623320 592 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 SEM1-224ENST00000623693 729 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092329.4-201ENST00000640838 583 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP3K19-205ENST00000392917 1765 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005072.1-201ENST00000606640 1779 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 NUSAP1-210ENST00000560177 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC244100.3-202ENST00000617328 1721 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 ASB8-205ENST00000536549 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 AC020978.8-201ENST00000571975 3022 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-12Q9BQ66 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 SERTAD3-202ENST00000392028 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM253-201ENST00000418511 1526 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX55P1-201ENST00000603334 1414 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF300P1-201ENST00000356555 1822 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 MITF-201ENST00000314557 1798 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 OLAH-201ENST00000378217 1767 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 HNRNPC-208ENST00000553753 1790 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 PLS3-AS1-202ENST00000607680 1763 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC172-201ENST00000333254 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 AKT3-202ENST00000336199 1688 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 AURKC-201ENST00000302804 1247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 KRTAP8-1-201ENST00000329621 556 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 GPR141-201ENST00000334425 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-12Q9BQ66 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms