Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP88Q99567 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms