Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms