Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Clec18aQ7TSQ1 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Clec18aQ7TSQ1 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Clec18aQ7TSQ1 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Clec18aQ7TSQ1 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Clec18aQ7TSQ1 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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