Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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GEN1Q17RS7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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GEN1Q17RS7 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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GEN1Q17RS7 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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GEN1Q17RS7 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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GEN1Q17RS7 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GEN1Q17RS7 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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