Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDKN3Q16667 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN3Q16667 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN3Q16667 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN3Q16667 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN3Q16667 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN3Q16667 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN3Q16667 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN3Q16667 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDKN3Q16667 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDKN3Q16667 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDKN3Q16667 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDKN3Q16667 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN3Q16667 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN3Q16667 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN3Q16667 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN3Q16667 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN3Q16667 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN3Q16667 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN3Q16667 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN3Q16667 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN3Q16667 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN3Q16667 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN3Q16667 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN3Q16667 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN3Q16667 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN3Q16667 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN3Q16667 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN3Q16667 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN3Q16667 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN3Q16667 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN3Q16667 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN3Q16667 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN3Q16667 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN3Q16667 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDKN3Q16667 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDKN3Q16667 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDKN3Q16667 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CDKN3Q16667 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CDKN3Q16667 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CDKN3Q16667 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDKN3Q16667 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDKN3Q16667 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDKN3Q16667 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CDKN3Q16667 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CDKN3Q16667 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CDKN3Q16667 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN3Q16667 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN3Q16667 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN3Q16667 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN3Q16667 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN3Q16667 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDKN3Q16667 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CDKN3Q16667 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN3Q16667 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN3Q16667 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN3Q16667 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CDKN3Q16667 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms