Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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BPTFQ12830 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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BPTFQ12830 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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BPTFQ12830 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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BPTFQ12830 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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BPTFQ12830 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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BPTFQ12830 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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BPTFQ12830 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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