Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 BOLA2P2-202ENST00000604904 567 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AC023302.1-201ENST00000607458 492 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 LIPK-201ENST00000404190 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 CCDC144NL-AS1-206ENST00000443508 1216 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 LINC00349-201ENST00000448748 841 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AC095050.1-201ENST00000502661 905 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AL352977.1-201ENST00000553464 453 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 LINC02251-201ENST00000554798 1224 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms