Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNA2D1P54289 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms