Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CTSSP25774 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CTSSP25774 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms