Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPREP23469 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPREP23469 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPREP23469 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPREP23469 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPREP23469 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPREP23469 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPREP23469 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPREP23469 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPREP23469 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPREP23469 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPREP23469 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPREP23469 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPREP23469 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPREP23469 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPREP23469 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPREP23469 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPREP23469 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPREP23469 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPREP23469 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPREP23469 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPREP23469 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPREP23469 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPREP23469 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPREP23469 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPREP23469 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPREP23469 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPREP23469 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPREP23469 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPREP23469 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPREP23469 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPREP23469 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPREP23469 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPREP23469 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPREP23469 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPREP23469 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPREP23469 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPREP23469 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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