Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLC9A1P19634 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC9A1P19634 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms