Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Myod1P10085 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Myod1P10085 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Myod1P10085 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Myod1P10085 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms