Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GOLGA8SH3BPF8 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms