Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
IGSF9BQ9UPX0 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IGSF9BQ9UPX0 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms