Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SH3GL2Q99962 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms