Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC84Q86UT8 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC84Q86UT8 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms