Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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