Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALD1Q05682 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALD1Q05682 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms