Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms