Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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IFT27Q9BW83 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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IFT27Q9BW83 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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IFT27Q9BW83 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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IFT27Q9BW83 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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IFT27Q9BW83 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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IFT27Q9BW83 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IFT27Q9BW83 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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