Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERPUD2Q9BSE4 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms