Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 DOCK6-201ENST00000294618 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 GNG4-204ENST00000450593 4978 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
LINC00208Q96KT6 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AL845472.1-202ENST00000624675 4080 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 LRRC8A-201ENST00000259324 4619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ERCC6L2-201ENST00000288985 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 FN1-202ENST00000336916 8435 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 RPH3A-202ENST00000415485 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 TNRC6C-201ENST00000301624 9632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 CEP170-204ENST00000366544 6805 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ANKRD17-202ENST00000358602 10784 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 GCC2-201ENST00000309863 7537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ZNF747-201ENST00000252799 3936 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 NRAP-201ENST00000359988 5580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 EBF1-201ENST00000313708 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 ATXN2-226ENST00000608853 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
LINC00208Q96KT6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms