Protein–RNA interactions for Protein: Q53GS9

USP39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39Q53GS9 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
USP39Q53GS9 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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