Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TTLL9Q3SXZ7 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms