Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms