Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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