Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRJQ12913 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms