Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCN7AQ01118 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN7AQ01118 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN7AQ01118 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN7AQ01118 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN7AQ01118 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN7AQ01118 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN7AQ01118 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN7AQ01118 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN7AQ01118 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN7AQ01118 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN7AQ01118 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN7AQ01118 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN7AQ01118 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN7AQ01118 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN7AQ01118 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN7AQ01118 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN7AQ01118 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN7AQ01118 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN7AQ01118 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN7AQ01118 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN7AQ01118 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN7AQ01118 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN7AQ01118 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN7AQ01118 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCN7AQ01118 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN7AQ01118 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN7AQ01118 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN7AQ01118 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN7AQ01118 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN7AQ01118 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCN7AQ01118 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms