Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDC42EP1Q00587 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms