Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCAMP43121 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCAMP43121 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCAMP43121 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCAMP43121 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCAMP43121 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCAMP43121 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCAMP43121 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCAMP43121 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCAMP43121 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCAMP43121 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCAMP43121 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCAMP43121 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCAMP43121 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCAMP43121 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCAMP43121 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCAMP43121 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCAMP43121 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCAMP43121 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCAMP43121 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCAMP43121 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCAMP43121 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCAMP43121 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCAMP43121 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCAMP43121 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCAMP43121 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCAMP43121 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCAMP43121 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MCAMP43121 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCAMP43121 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCAMP43121 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCAMP43121 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MCAMP43121 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCAMP43121 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCAMP43121 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCAMP43121 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCAMP43121 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCAMP43121 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCAMP43121 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCAMP43121 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCAMP43121 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCAMP43121 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCAMP43121 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCAMP43121 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCAMP43121 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCAMP43121 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCAMP43121 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MCAMP43121 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCAMP43121 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MCAMP43121 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MCAMP43121 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MCAMP43121 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCAMP43121 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCAMP43121 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCAMP43121 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCAMP43121 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCAMP43121 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCAMP43121 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCAMP43121 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCAMP43121 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCAMP43121 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCAMP43121 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCAMP43121 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MCAMP43121 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCAMP43121 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCAMP43121 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCAMP43121 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MCAMP43121 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCAMP43121 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCAMP43121 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCAMP43121 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCAMP43121 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCAMP43121 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCAMP43121 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCAMP43121 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCAMP43121 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCAMP43121 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCAMP43121 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCAMP43121 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCAMP43121 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCAMP43121 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCAMP43121 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCAMP43121 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCAMP43121 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCAMP43121 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCAMP43121 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCAMP43121 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCAMP43121 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCAMP43121 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCAMP43121 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCAMP43121 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCAMP43121 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MCAMP43121 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCAMP43121 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCAMP43121 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MCAMP43121 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MCAMP43121 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCAMP43121 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MCAMP43121 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MCAMP43121 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms