Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF7Q9UBF6 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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