Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSD3Q9NYI0 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms