Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NLRP1Q9C000 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 271.3 ms