Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
C9orf16Q9BUW7 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms