Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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PRPF18Q99633 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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PRPF18Q99633 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRPF18Q99633 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRPF18Q99633 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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