Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BHLHA9Q7RTU4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms