Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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LAMA3Q16787 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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