Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CDSNQ15517 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms