Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GRIK2Q13002 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GRIK2Q13002 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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