Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FAM27E3Q08E93 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FAM27E3Q08E93 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms