Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DEUP1Q05D60 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms