Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN1P18031 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN1P18031 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms